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#生物化学 #酶 #分类
1. 酶的分类
1.1 按分子组成分类
- 单纯蛋白酶
- 结合蛋白酶
- 脱辅酶(酶蛋白) (易透析去除)
- 辅助因子
- 辅酶 (与酶蛋白结合疏松,易透析去除)
- 辅基 (与酶蛋白结合紧密,不易透析去除)
1.2 按化学本质分类
- 蛋白酶:化学本质是蛋白质
- 核酶:化学本质是核酸
1.3 按功能分类
- EC1:氧化还原酶
- EC2:转移酶
- EC3:水解酶
- EC4:裂解酶
- EC5:异构酶
- EC6:连接酶
2. 酶的催化作用
2.1 分子结构与催化作用
- 活性中心: 酶分子中与底物特异性结合并催化其转化的三维结构区域。
- 必需基团:
- 位于活性中心内: 结合基团(识别底物)、催化基团(催化反应)。
- 位于活性中心外: 维持构象或作为调节位点。
- 常见基团: 丝氨酸羟基、组氨酸咪唑基、半胱氨酸巯基、酸性氨基酸羧基。
- 必需基团:
- 催化机制:
- 诱导契合、邻近效应、表面效应:促进底物结合和去溶剂化。
- 过渡态稳定化:降低活化能。
- 酸碱催化、亲核催化、共价催化。
NOTE
酶的高效催化依赖于活性中心的精确结构,诱导契合模型解释了酶与底物的动态结合过程。
2.2 酶促反应特点
- 高效性和专一性。
- 对环境敏感, 反应条件温和(常温、常压、中性 pH)。
- 可调节性(受抑制剂和激活剂影响)。
TIP
酶的专一性
- 键专一性:酶仅对底物分子中特定的化学键类型进行催化,而对键两端连接的具体基团要求不严格。如胰蛋白酶,它能水解蛋白质中由赖氨酸或精氨酸的羧基形成的肽键,但对肽键两侧的氨基酸种类(只要其中一侧是赖氨酸或精氨酸)要求相对宽松
- 基团专一性:不仅要求特定的化学键,还对键的某一端连接的基团有特定要求。如碱性磷酸酶能水解多种磷酸单酯(如甘油磷酸酯、葡萄糖-6-磷酸),但对磷酸二酯(如 DNA 中的磷酸二酯键)几乎无作用。它要求底物必须是磷酸单酯键,作用是去除磷酸基团,对酯键另一侧的醇基团有一定容忍度
- 绝对专一性:只催化一种特定底物或一种特定反应,对结构稍异的类似物均无作用。如脲酶,仅能催化尿素水解为二氧化碳和氨,对尿素的甲基取代物(如甲基尿素)或其他酰胺类物质均不起作用
- 立体异构专一性:能区分底物的立体异构体(如旋光异构、几何异构),通常只作用于其中一种。如 L- 氨基酸氧化酶,仅催化 L- 构型的氨基酸氧化,对 D- 构型氨基酸完全无效
2.3 酶-底物复合物
- 定义: 酶与底物通过非共价键形成的临时复合物(ES 复合物)。
- 特征: 可逆结合,稳定过渡态。
- 模型:
- 锁钥模型: 活性位点与底物完全匹配。
- 诱导契合模型: 酶构象适应底物。
3. 酶的辅助因子
3.1 维生素与辅酶
- 许多维生素转化为辅酶:
- 烟酰胺(VB3)→ NAD⁺
- 硫胺素(VB1)→ TPP
- 核黄素(VB2)→ FMN/FAD
- 维生素 B6 → PLP
3.2 辅酶作用
- 电子传递:NAD⁺、FAD。
- 质子转移:辅酶 A(CoA)。
- 分子转移:SAM(甲基转移)。
- 底物稳定:辅助催化。
3.3 金属离子作用
- 作为辅助因子(如 Zn²⁺、Fe²⁺、Mg²⁺、Cu²⁺),参与结构稳定、催化活性、电子转移。
TIP
辅酶和金属离子通过与酶协同作用,增强催化效率或特异性,广泛参与代谢反应。