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#生物化学 #酶 #分类

1. 酶的分类

1.1 按分子组成分类

  1. 单纯蛋白酶
  2. 结合蛋白酶
    • 脱辅酶(酶蛋白) (易透析去除)
    • 辅助因子
      • 辅酶 (与酶蛋白结合疏松,易透析去除)
      • 辅基 (与酶蛋白结合紧密,不易透析去除)

1.2 按化学本质分类

  1. 蛋白酶:化学本质是蛋白质
  2. 核酶:化学本质是核酸

1.3 按功能分类

  • EC1:氧化还原酶
  • EC2:转移酶
  • EC3:水解酶
  • EC4:裂解酶
  • EC5:异构酶
  • EC6:连接酶

2. 酶的催化作用

2.1 分子结构与催化作用

  • 活性中心: 酶分子中与底物特异性结合并催化其转化的三维结构区域。
    • 必需基团:
      • 位于活性中心内: 结合基团(识别底物)、催化基团(催化反应)。
      • 位于活性中心外: 维持构象或作为调节位点。
      • 常见基团: 丝氨酸羟基、组氨酸咪唑基、半胱氨酸巯基、酸性氨基酸羧基。
  • 催化机制:
    • 诱导契合、邻近效应、表面效应:促进底物结合和去溶剂化。
    • 过渡态稳定化:降低活化能。
    • 酸碱催化、亲核催化、共价催化。

NOTE

酶的高效催化依赖于活性中心的精确结构,诱导契合模型解释了酶与底物的动态结合过程。

2.2 酶促反应特点

  • 高效性和专一性。
  • 对环境敏感, 反应条件温和(常温、常压、中性 pH)。
  • 可调节性(受抑制剂和激活剂影响)。

TIP

酶的专一性

  • 键专一性:酶仅对底物分子中特定的化学键类型进行催化,而对键两端连接的具体基团要求不严格。如胰蛋白酶,它能水解蛋白质中由赖氨酸或精氨酸的羧基形成的肽键,但对肽键两侧的氨基酸种类(只要其中一侧是赖氨酸或精氨酸)要求相对宽松
  • 基团专一性:不仅要求特定的化学键,还对键的某一端连接的基团有特定要求。如碱性磷酸酶能水解多种磷酸单酯(如甘油磷酸酯、葡萄糖-6-磷酸),但对磷酸二酯(如 DNA 中的磷酸二酯键)几乎无作用。它要求底物必须是磷酸单酯键,作用是去除磷酸基团,对酯键另一侧的醇基团有一定容忍度
  • 绝对专一性:只催化一种特定底物或一种特定反应,对结构稍异的类似物均无作用。如脲酶,仅能催化尿素水解为二氧化碳和氨,对尿素的甲基取代物(如甲基尿素)或其他酰胺类物质均不起作用
  • 立体异构专一性:能区分底物的立体异构体(如旋光异构、几何异构),通常只作用于其中一种。如 L- 氨基酸氧化酶,仅催化 L- 构型的氨基酸氧化,对 D- 构型氨基酸完全无效

2.3 酶-底物复合物

  • 定义: 酶与底物通过非共价键形成的临时复合物(ES 复合物)。
  • 特征: 可逆结合,稳定过渡态。
  • 模型:
    • 锁钥模型: 活性位点与底物完全匹配。
    • 诱导契合模型: 酶构象适应底物。

3. 酶的辅助因子

3.1 维生素与辅酶

  • 许多维生素转化为辅酶:
    • 烟酰胺(VB3)→ NAD⁺
    • 硫胺素(VB1)→ TPP
    • 核黄素(VB2)→ FMN/FAD
    • 维生素 B6 → PLP

3.2 辅酶作用

  • 电子传递:NAD⁺、FAD。
  • 质子转移:辅酶 A(CoA)。
  • 分子转移:SAM(甲基转移)。
  • 底物稳定:辅助催化。

3.3 金属离子作用

  • 作为辅助因子(如 Zn²⁺、Fe²⁺、Mg²⁺、Cu²⁺),参与结构稳定、催化活性、电子转移。

TIP

辅酶和金属离子通过与酶协同作用,增强催化效率或特异性,广泛参与代谢反应。

CC BY-SA 4.0